其核心战术思想是利用步兵极高的攻击速度以及针对敌方特殊单位的克制能力，在正面交锋中建立优势，同时结合远程火力与攻城武器破除敌方防线，并凭借经济与海战上的额外加成来巩固胜势。从黑暗时代开始，日本的运营就需要为步兵路线进行规划，充分利用其磨坊、伐木场和采矿营地造价便宜的经济优势，快速积累食物和木材，为早期军事行动打下基础。进入封建时代后，步兵攻击速度加成的特性开始激活，此时训练剑士配合箭塔进行推进或防御是不错的选择，能够在小规模冲突中占据上风。这个阶段的重点是保护资源区，并适时地升级到城堡时代，为精锐武士的登场做准备。
城堡时代是日本发挥其特色兵种威力的关键时期。精锐武士凭借其对其他文明特色单位的高额附加伤害和自身的快速攻击，成为处理敌方核心威胁的王牌兵种。使用武士时，必须搭配一定数量的长戟兵作为前排，以吸收伤害并防范敌方骑兵的冲锋突袭，保护后方脆弱的武士和远程单位。应考虑建造攻城武器作坊，生产冲车或投石机来应对敌方的建筑群，为步兵军团扫清障碍。
当战局进入帝王时代，日本应升级出冠军剑士，他们构成了步兵海的中坚力量。此时的终极搭配通常是冠军剑士与长戟兵组成的主力近战军团，辅以火枪手或劲弩手提供远程火力支持，并由巨型投石机或手推炮负责攻坚和范围杀伤。日本的弹射器科技能显著提升巨型投石机的打包、拆装和攻击速度，这使得他们在攻城战中更具压迫感。面对不同的对手，需要灵活调整兵种比例，例如对抗骑兵文明时增加长戟兵的数量，而面对弓箭手集群时则要让武士更快地贴近敌人。
海战与控制也是日本的重要战术维度。其渔船拥有双倍生命值和额外的远程护甲，且工作效率随时代提升，这使得他们在海图上拥有强大的经济恢复能力。战舰则拥有更广的视野，有利于掌握水域情报。在陆海结合的地图上，利用海军优势保障渔业经济，同时从陆路发动步兵攻势，可以形成立体化的打击。在资源管理上，要持续发挥经济建筑造价低廉的优势，确保在战斗中能够维持源源不断的兵力补充，通过持续施压来击垮对手。
